Momsloven fritager museer for moms, men disse virksomheder skal i stedet betale lønsumsafgift, medmindre virksomheden også er fritaget for lønsumsafgift.
Den 1. januar 2009 blev lønsumsafgiftsloven ændret, sådan at det alene var museer, der var omfattet af museumsloven eller blev drevet i tilknytning til universitetsloven, der blev fritaget.
Det blev dengang forudsat, at alle andre museer allerede betalte lønsumsafgift.
Dette var imidlertid ikke tilfældet, da de indtil 1. januar 2009 faktisk havde været fritaget efter en anden bestemmelse, der samtidig blev ophævet, og det medførte en ulige behandling af de danske museer, der nu med den nye ændring af lønsumsafgiftsloven ændres. Denne fritager museumsvirksomhed som sådan og sikrer dermed ligestilling mellem museerne.
Ændringen har virkning fra 1. januar 2009.
Museer, der har afholdt lønsumsafgift, vil derfor kunne få den tilbagebetalt hos SKAT.